A gasztroenterológia ógörög eredetű összetett szó: gasztro szó gyomrot, az entero „bélhez tartozó”-t, a logosz pedig tudományt jelent, tehát összefoglalva a gyomor és a belek működésével foglalkozó tudományág. Kicsit pontosítva, a belgyógyászat és a gyermekgyógyászat egyik szakága, mely a nyelőcső, a gyomor és bélrendszer, valamint a máj, epe és hasnyálmirigy működésére és ezek betegségeire specializálódott.
Az endoszkópia (pl. gyomortükrözés, vastagbéltükrözés) révén azonban átmeneti tudományág a belgyógyászat és a sebészet között, hiszen az endoszkópia az ún. mikroinvazív sebészet részét képezi.
A gasztroenterológia tehát a gyomor-bélrendszer normál és kóros állapotainak megítélésével és gyógyításával foglalkozó szakterület. A nyelőcső, gyomor, vékonybél, vastagbél, végbél, máj, hasnyálmirigy, epeutak megbetegedéseit, továbbá a táplálkozással és az ezzel összefüggő felszívódási zavarokat, élelmiszerek okozta betegségeket vizsgálja, gyógyítja és/vagy terápiás megoldást nyújt.